违纪员工去仲裁？？？

   最近遇到这样一名员工，自己违规还扬言去仲裁！


   该员工是商场一名销售人员，为了去参加朋友的婚礼向直接领导申请事假2天，并未得到直属上级的批复后便开始休假，直属领导告知不用再上班并将其员工私自休假的那两天算作旷工，但该员工确说当时生病。说那两天假期已通过电话请示领导后才休的，并说生病怎么可以再去上班。在此期间，还发现该员工在上班期间有早退现象，考勤卡下班时间乃是同事帮忙代打。等员工上班后，直属领导针对上述事情向该员工出具警告书并要求签字确认时，该员工“据理力争”，一概否认以上说法，并说自己并未早退和找人代打卡，休假也是得到领导批复后休的。此员工情绪激动，与直属领导产生激烈矛盾，并将其电话打给人事部负责人。人事部开始向双方了解情况，发现该员工和直属领导说法正好相反，直属领导告知该员工确实存在以上问题，店内员工可以证明，另帮忙代打卡者已承认错误，愿意接受公司的处罚，可该员工却声称直属领导与店内员工篡通好了。此外，拿走考勤卡，作为证据。并扬言如处理结果不能令其满意，将去申请仲裁。


请问如果你是人事部负责人，对此你该如何处理？


补充：公司关于迟到早退、代打卡以及请假制度有明确的规定。

《违纪员工去仲裁》续

当人事部与该员工就上述发生的事情，与其沟通时，该员工仍是拒不承认，说是诬蔑她，同时向人事部提出，如果公司的处理结果不能令其满意，将去申请仲裁，并告公司克扣员工的工资。这时，人事部又面临了另外一个事请：自从该员工入职以后，直至现在一直未办理相关的入职手续，根据劳动合同法的规定，已经超过一个月的期限。人事部相关的负责人曾多次要求员工去签订劳动合同，办理保险和档案关系。可该员工一直以资料未备齐延后再办。那么按照公司的规定，也为了避免存在不必要地风险，所有未办齐入职手续的员工一律不予发放工资，等办齐后再一起发放（一起发放工资还因该地区保险缴费比例偏高。如果保险关系未转入公司名下，先发放工资，等将保险转入后，当月工资就要扣去很多保险费，包括补缴费用，另销售人员工变动较大，如果分月扣的话，部分员工中途离职时，保险还未扣完。）。

对此，想问该员工此种情况算克扣员工的工资？克扣工资的衡量标准是什么？

如果该员工拿公司的考勤卡（其上未有公司名称）去申请仲裁，仲裁会受理吗？

如果仲裁受理的话，同事作证该员工确实存在以上违规违纪的现象，如与同事互相代打卡。仲裁委员会会接受吗？