楼主还缺少一些经验和管理手段
2000多人的两个工厂，可能是生产密集型企业吧，人手数量还是差不多，关键是，比较缺乏类似的挫折，也许是工作比较顺吧。琐碎的事情多，不是其他人的问题，是你个人的问题，部门经理不应该这么忙，值得考虑一下自己在管理手段和用人方面问题，自己是不是喜欢什么事情都抓，员工是不是喜欢躲事情？自己有没有能力安排和分配一下工作？首先减轻自己的精力压力！
对于一些看似很小的问题，其实还是你出了问题，有没有约束！员工大错不范小事不断，可能员工比你还油多了，责任还是你在背，员工一定要对自己范的任何小事负责，如果公司/部门没有绩效考核，想想办法临时建立一些类似手段，避免员工小错。其次是减轻责任压力。
然后才谈的上你要怎么部门内建立规范，等等一些措施，
如果前面两项没有做好，建议你可以准备辞职的事情了，老老实实去多做几年HR部门员工，看看HR经理怎么当经理的。
万事都是自己的问题，有的经理，空投到你的职位，也能管住这帮老油条。多思考思考自己的问题吧。
只代表个人意见，欢迎讨论！
这样的HR部门,该咋整?
我给你一点意见希望我能抛砖引玉的效果.也希望能得到各位高手们的指点...非常愿意和大家做朋友...QQ:277939179我认为你提到的问题应该是好多公司也都有的.我给你以下几点小小的看法:第一、给自己树立一个信心，最好把人力资源部的人招集起来开一个会，就是对公会现在的情况来给个方案出来。要达到什么样的效果提出来，这样有目的性才能在以后的工作中做得更好。第二、我认为楼上有位说得很对，就是让下面的人有一个程序化的工作，你做为人力资源部的经理，是要好好的领导他们把事干好。第三、因为公司里面裙带关系严重，那么我建议你跟下面的员工，事实上你就只有6个。和他们每一个面谈一次，要了解他们在想什么，这样才能集团队的思想，只有发动了他们以后你的事才能做得很好。第四、你现在老板也觉得你做得不好，我觉得你应该有一个总结和计划向老板汇报一下，一来你可以让他明白你的难处，二来让他觉得你在公司里面不是什么都没有做。我认为做为人力资源部门如果做什么不能得到上级的大力支持是没有办法做好的。
我目前想到的也就只有这么几点，希望对你有一点帮助。也真诚期盼大家对我指出不足之处，让我在以后的学习当中有所提高。