明确制度、合理分工、规范流程，这些工作都是要做的
与其养着这些不给公司带来价值的人，还不如快刀斩乱麻，直接协商走人。按最坏的打算，双倍赔偿。
把这种机会留给有素养的人。
1、监守自盗劳动合同：之前听说过一个这种案例，是HRD的，员工专业且证据确凿，但后来败诉，是因为企业证明了其是负责公司人事政策制定及执行的负责人，所有诉讼内容为其履行公司职责的内容；
2、三期：这个确实很难，首先打感情牌吧，原则是不能让其影响公司其他同事的正常工作，氛围坏了是大事，要让员工看到公司对员工的态度和诚意，这个很关键；再就是取证，收集证据以严重违纪辞退，可以考虑利用之前监守自盗的事情；所有办法对于要脸的人是有用的，对于不要职场自尊的还真是没啥好办法，唯一的办法就是你比她还...
先礼后兵，企业要人性化，但同时企业不是福利院，说到，然后再做到，就没有什么可说的了
如果能在坐下来协商沟通处理，或者督导改进，或者协商解约，但是要“威逼利诱”，有证据证明她错了、知道对方怕什么，给出路，让其借坡下驴。
如果协商或者法律层面解决不了，那就麻烦一点，请神容易送神难，分情况处理了。
建议首选是感情牌，怀孕的三期的确有法律保护，但从人性来说，一个即将要当妈妈的人，内心一定是柔软的，之前的行为有一定的原因，而且应该是和她的顶头上司有关，楼主是新来的，是她的最高顶头上司，有对她和她上级的生杀大权，感觉稍稍了解清楚再处理为好。
试想，如果我们是仲裁员，心理上也会偏向孕妇，况且到时候还是先调解，不宜弄得太僵。如果她不买账，不给自己留后路，也注意保存证据，可以讲处理过程和结果在内网匿名公开，这样不至于造成太大负面影响。不然不明事理的人还以为楼主一来就拿孕妇开刀呢。
我刚来现在的公司不久，当时新入职遇到一未及时续签劳动合同的，一直拖着不签，第一反应是个难缠的主儿，后来了解发现此人在公司高管层和他上一级领导中有很好的朋友，人缘不错。什么情况都按照劳动法等规定处理是没错的，尤其大公司，但是每人都有根基在，虽然孕妇的行为让人忍无可忍，但如何做的漂亮还是请楼主三思。
同意楼上的说法，要想调查清楚并不难，给她个台阶下，皆大欢喜是最好的，如果敬酒不吃吃罚酒，反而好办了~
公司的规章制度首先不能和国家法律法规冲突，其次要有严格的制定程序，员工代表大会或者工会通过，公示，最强的证据是员工签字的“已知悉并同意遵守以上制度”，很显然现在这些证据目前不具备。楼主现在要重新做这些必然需要一个过程。
感谢大家的指点，人家现在的政策是非暴力不合作，天天在公司不说一句话，我不理你，谁都不理。你找我谈话我去，但是就是不说话！
首先要与该员工谈谈，看是什么原因导致她现在这种情况，尽量能够协商解决；其次要给其下达工作任务，对于工作任务完不成要进行绩效考核，绩效考核要与工资挂钩；再次对于工作完成情况每天晨会进行通报，没有完成的，在晨会上需要说明原因。